『彼女』と織りなす、真実のマテリアルブレイブ
死力を賭した絵奈との戦いの末、遙歩はアンリーシュトとしての能力を無くし、絵奈は繭状のエニグマタイトの塊となり眠りについた。自らの能力を取り戻し、絵奈を元に戻すため、旅に出た遙歩と『彼女』。しかし旅の途中、神尾城島の研究所より繭の絵奈に異常があったと知らせが入り、遙歩達は再び神尾城島に戻ってくることになる。
神尾城島に戻ってきた遙歩達が目にしたのは、新種のネオプラズムに襲われる研究所だった。能力のない遙歩は苦戦するが、『彼女』たちの助けを借りてなんとか絵奈の元にたどり着く。旅立った時より、小さく縮み生体反応の弱った絵奈の繭。近づくと絵奈の声が聞こえる。同時に、新種のネオプラズムが遙歩と絵奈を襲う。重傷を負いつつも、ネオプラズムを撃退した遙歩。意識朦朧としながら絵奈の繭に触れると、あふれる光の中で絵奈の苦しげな声を聞く。
「終末の獣……新しい敵……」
その意味を理解するまもなく、意識を取り戻した遙歩。だが、絵奈との再会は、遙歩のアンリーシュトとしての能力を復活させた。絵奈がくれた力。それを胸に遙歩はネオプラズムを退ける。遙歩は『彼女』とともに学園に戻り、今回の事件を調べることにする。帰ってきた遙歩をチームメイトは再びリーダーとして迎え入れてくれるのだった。
「おかえり、鏑木遙歩！」
だが、数々の謎が遙歩たちチームユニゾンの前に立ち塞がる。新種ネオプラズム、復活のエヴォルツィオン、終末の使徒、そして終末の獣……。強大な敵との戦いの幕開け。問われる力の在処は何処に――
――進化のその先へ。
